Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21977F6U3N7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm21977F6U3N7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm21977F6U3N7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms