Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf212F6TQD1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf212F6TQD1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms