Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17430F6RSK3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17430F6RSK3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17430F6RSK3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17430F6RSK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms