Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Col22a1E9Q7P1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col22a1E9Q7P1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col22a1E9Q7P1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col22a1E9Q7P1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms