Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srsf11E9Q6E5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf11E9Q6E5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf11E9Q6E5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms