Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4930523C07RikE9Q2T4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930523C07RikE9Q2T4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
4930523C07RikE9Q2T4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930523C07RikE9Q2T4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms