Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1110002E22RikE0CYV9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1110002E22RikE0CYV9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1110002E22RikE0CYV9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms