Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
4930407I10RikD3Z5T8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
4930407I10RikD3Z5T8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
4930407I10RikD3Z5T8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
4930407I10RikD3Z5T8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms