Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed7D3YZZ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed7D3YZZ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms