Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SafbD3YXK2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SafbD3YXK2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SafbD3YXK2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SafbD3YXK2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms