Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm17333C6EQI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17333C6EQI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17333C6EQI3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms