Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6133B2RY53 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6133B2RY53 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm6133B2RY53 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm6133B2RY53 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms