Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hbb-bh2B2RVB7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms