Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC45.35■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Abcc8B2RUS7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC45.27■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
Abcc8B2RUS7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC45.23■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
Abcc8B2RUS7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC45.19■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
Abcc8B2RUS7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Abcc8B2RUS7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.8
Abcc8B2RUS7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Abcc8B2RUS7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Abcc8B2RUS7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Abcc8B2RUS7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Abcc8B2RUS7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Abcc8B2RUS7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
Abcc8B2RUS7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Abcc8B2RUS7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms