Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba1B2RUJ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba1B2RUJ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba1B2RUJ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba1B2RUJ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba1B2RUJ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apba1B2RUJ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apba1B2RUJ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba1B2RUJ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms