Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrn3B2RS91 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrn3B2RS91 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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