Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BC035947B2RQY6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC035947B2RQY6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC035947B2RQY6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms