Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brpf3B2KF05 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf3B2KF05 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf3B2KF05 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms