Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tbc1d2B1AVH7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d2B1AVH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d2B1AVH7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms