Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rhox1B1APN4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rhox1B1APN4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox1B1APN4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox1B1APN4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms