Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skor2A7M7C7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor2A7M7C7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms