Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm16430A6X8J1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm16430A6X8J1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16430A6X8J1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm16430A6X8J1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms