Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herc3A6H6S0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herc3A6H6S0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herc3A6H6S0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Herc3A6H6S0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Herc3A6H6S0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc3A6H6S0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Herc3A6H6S0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms