Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatsperbA2RTF1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatsperbA2RTF1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatsperbA2RTF1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms