Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramef17A2ASJ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramef17A2ASJ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramef17A2ASJ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms