Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Patl2A2ARM1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Patl2A2ARM1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Patl2A2ARM1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms