Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam205aA2APU8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam205aA2APU8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam205aA2APU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms