Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttll9A2APC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll9A2APC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll9A2APC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll9A2APC3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms