Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rhox3fA2ANE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox3fA2ANE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3fA2ANE1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3fA2ANE1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms