Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd7A2AJK6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd7A2AJK6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd7A2AJK6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms