Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramel3A2AHA7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramel3A2AHA7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramel3A2AHA7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pramel3A2AHA7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramel3A2AHA7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramel3A2AHA7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel3A2AHA7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms