Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Itgb4A2A863 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Itgb4A2A863 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itgb4A2A863 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Itgb4A2A863 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms