Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pabpc1lA2A5N3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pabpc1lA2A5N3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pabpc1lA2A5N3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pabpc1lA2A5N3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms