Protein–RNA interactions for Protein: A1EGX6

Fscb, Fibrous sheath CABYR-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FscbA1EGX6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FscbA1EGX6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FscbA1EGX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FscbA1EGX6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FscbA1EGX6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FscbA1EGX6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FscbA1EGX6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms