Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cc2d2bA0A286YDU8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cc2d2bA0A286YDU8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cc2d2bA0A286YDU8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cc2d2bA0A286YDU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cc2d2bA0A286YDU8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms