Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms