Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms