Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 435.7 ms