Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv26A0A0B4J1P5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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