Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm28171A0A087WQ19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28171A0A087WQ19 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28171A0A087WQ19 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms