Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms