Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knop1Q9Z2Q2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knop1Q9Z2Q2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Knop1Q9Z2Q2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms