Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn7Q9Z261 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn7Q9Z261 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn7Q9Z261 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms