Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi1Q9Z185 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Padi1Q9Z185 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Padi1Q9Z185 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms