Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabbr1Q9WV18 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gabbr1Q9WV18 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gabbr1Q9WV18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms