Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn3Q9WUK7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms