Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnfsf13bQ9WU72 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfsf13bQ9WU72 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms