Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmeff2Q9QYM9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmeff2Q9QYM9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms