Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nufip1Q9QXX8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nufip1Q9QXX8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nufip1Q9QXX8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nufip1Q9QXX8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nufip1Q9QXX8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nufip1Q9QXX8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nufip1Q9QXX8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nufip1Q9QXX8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nufip1Q9QXX8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nufip1Q9QXX8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms