Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cml5Q9QXS8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cml5Q9QXS8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms